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进入第二研发阶段，由于通讯解禁、设备齐全、与同事合作默契，方岐感到工作和生活愈加如意，最新完成的一项材料实验也取得了出人意料的好成果。
不只是方岐，几乎所有留任的核心小组成员对研发任务都感到更得心应手，尤其是龙哲飞。两年多的时间里，他超额完成学习任务，吃透了的数学、计算机科学、细胞学等典籍装满了整整两大间书房。雷雱发现他近乎过目不忘，曾惊讶地评价道：活生生的人类奇迹。
第二阶段的重要任务之一是大规模计算收集到的微弱脑电波，并排除其中的无用信号，分工后的第二天，龙哲飞就提出了32种方案，快速自学了神经生物学后，又将这32种方案重新完善，并归纳出重要的理论建设。
半年后，方岐与李邈远、葛彩芽共同研制的纳米组合探针顺利通过各项测试，是为重大进展。
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